Некоторые отличия морфологии мух разных видов:

• Строение ротового аппарата. 23 У разных видов он может быть лижущего или колюще-сосущего типа. 2 Например, у комнатной мухи (Musca domestica) ротовой аппарат лижущего типа, а твёрдые вещества она растворяет слюной. 2 У осенней жигалки (Stomoxys calcitrans) тело бурое, на брюшке имеются тёмные округлые пятна, на спинке серого цвета — продольные тёмные полосы. 2
• Размер и особенности тела. 5 Например, вольфартова муха (Wohlfahrtia magnifica) имеет светло-серый цвет и чёрные круглые пятна на брюшке. 5 Мухи це-це (Glossina palpalis и G. morsitans) отличаются крупными размерами (от 6,5 до 13,5 мм в длину), выступающим вперёд сильно хитинизированным хоботком, тёмными пятнами на спинной стороне брюшка и характерным складыванием крыльев в покое. 5

Также у разных видов могут отличаться цвет и рисунок на груди: например, у комнатной мухи (Musca domestica) общий цвет груди со стороны спинки серо-бурый, а на груди выделяются четыре тёмные продольные полосы. 25