«Наутилус Помпилиус» как моллюск интересен тем, что название группы происходит от названия вида этих животных. 12
В 1985 году Илья Кормильцев, автор большинства текстов группы, предложил добавить «Помпилиус» (Nautilus pompilius) для того, чтобы избежать путаницы, так как в СССР уже существовало несколько коллективов с названием «Наутилус». 12 В сопроводительной записке ко второму альбому группы «Невидимка» об этом было написано: «Группа названа в честь голожаберного моллюска, который от природы красив и обаятелен». 3