Смысл фильма «Три тысячи лет желаний» заключается в том, что одиночество — это один из множества даров человеку, который можно разделить на двоих. 1
Картина также посвящена темам любви и значимости истории в жизни человека — тому, как важно передавать истории из поколения в поколение и изменять их с течением времени. 1 Фильм показывает, как мировая культура и тяга людей к историям влияют на всё человечество: благодаря передаваемым рассказам человек не только развлекается, но и учится, вдохновляется на достижение великих целей, обретает надежду и смысл жизни, а также находит близких по духу людей. 1
В финале картины джинн наконец-то обретает долгожданную свободу и возвращается в царство себе подобных, а Алетейя понимает, что не стоит бояться сближаться с людьми, даже если ты по натуре одиночка. 13