Некоторые способы отмены электронного счёта-фактуры:

• Заключение соглашения с контрагентом. 1 В нём нужно прописать, что на основании ошибочного файла не возникает гражданско-правовых последствий. 1 При этом важно проверить полномочия тех, кто от имени партнёра подпишет соглашение. 1
• Отзыв электронного счёта-фактуры. 5 Для этого нужно непосредственно в информационной системе электронного документооборота или из программы, в которой активирован сервис 1С:ЭДО. 5 При отзыве аннулируются только основной счёт-фактура и все сопровождающие документы. 5
• Аннулирование регистрационных записей. 2 Чтобы исключить счёт-фактуру из налогообложения, достаточно не производить его регистрацию в книге продаж, книге покупок, журнале учёта полученных и выставленных счетов-фактур или аннулировать ранее внесённые регистрационные записи. 2

Законодательством не предусмотрено аннулирование электронных счетов-фактур, но есть возможность внести исправления путём составления новых экземпляров с указанием номера и даты исправления. 24