Преференции и налоговые льготы имеют общую цель — снижение итоговой налоговой нагрузки налогоплательщика. 4 Они стимулируют развитие тех или иных видов деятельности. 4

Основное отличие заключается в механизме действия:

• Преференции имеют обязательный характер, приостановление их применения невозможно. 14 За неприменение и неправильное применение преференций предусмотрены штрафы, в то время как неприменение льгот не штрафуется. 4
• Налоговые льготы предоставляются по желанию налогоплательщика, он может на неопределённый период приостановить их использование, а затем вновь восстановить. 4

Ещё одно отличие — при возникновении у налогоплательщика вопросов, касающихся применения налоговой преференции, уполномоченный орган обязан дать разъяснение по письменному заявлению налогоплательщика. 1 При применении льгот налоговые органы не обязаны разъяснять их применение. 1