Посёлок Депутатский считается одним из самых удалённых и труднодоступных в Якутии из-за своего географического положения. 34 Он расположен в Селенняхском хребте, примерно в 930 километрах к северо-северо-востоку от Якутска, столицы республики. 3
Территория посёлка находится в зоне залегания вечной мерзлоты, ограничена с севера и с запада Верхоянским хребтом, с юга — хребтом Черского. 5 Местность имеет холмистый рельеф, отдельные высоты которого достигают 500–1000 метров. 5 Район сильно расчленён сетью рек бассейнов реки Яна и левобережных притоков реки Индигирка. 5
В летнее и зимнее время связь с посёлком осуществляется только воздушным путём. 5