Капские горы считаются экологически важной зоной благодаря своему видовому разнообразию. 35 В области произрастают около 9 000 видов высших растений, до 90% из которых — эндемики. 35

Также природные ландшафты Капских гор представлены вечнозелёными кустарниками и редколесьями на коричневых почвах (на западе) и смешанными вечнозелёными лесами на горных бурозёмах (на востоке). 2 Для подветренных склонов и межгорных долин характерны полупустыни на серо-коричневых почвах. 2

Кроме того, в Капской области создано около 100 охраняемых природных территорий, в том числе заповедники Седерберх, Анисберх, национальный парк Свартберге. 2 В 2004 году охраняемые территории Капской флористической области были причислены к объектам Всемирного наследия ЮНЕСКО. 35