В Южном федеральном округе представлены следующие природные зоны:

• Степная зона. 5 Расположена от северных границ округа. 5
• Предгорная зона. 5 Находится южнее и тянется неширокой полосой с юго-востока на северо-запад, постепенно переходя в систему горных отрогов. 5
• Горная зона. 5 Располагается ещё южнее и включает Черноморский, Кубанский, Терский и Дагестанский Кавказ. 5

Также на юге округа представлены полупустыни, пустыни и субтропики. 3

Растительность округа включает смешанные, хвойные и лиственные леса, степи и субальпийские луга. 24