Замкнутость Белого моря влияет на его фауну и флору следующим образом:

• Фауна и флора моря существенно обеднены по сравнению с таковыми Баренцева моря и составляют в среднем 50–70% от числа видов в его соседних участках. 3
• Замкнутость и небольшие размеры моря влияют на приливы и отливы: их амплитуда получается небольшой, в среднем в полтора метра, хотя в некоторых небольших узких заливчиках доходит до семи. 1
• Зимнее перемешивание толщи воды в Горле приводит к формированию холодных вод с повышенной для моря солёностью, которые, скатываясь в котловину внутренней части Белого моря, формируют глубинную беломорскую воду. 5 Эта водная масса круглый год сохраняет отрицательную температуру и определяет многие свойства экосистемы как арктической по своему характеру. 5