Вирусы и бактерии влияют на экосистему и пищевые цепи следующим образом:

• Вирусы влияют на численность бактерий и фитопланктона. 1 Зараженные клетки превращаются в вирусы и продукты распада, которые поглощаются бактериями и более крупными протистами. 1 В результате остальная часть пищевой сети лишается притока органических питательных веществ, поэтому биомасса и продуктивность верхних ярусов пищевой пирамиды уменьшаются. 1 Также лизис фитопланктона под действием вирусов лишает питания вышестоящие звенья пищевых цепей и приводит к перераспределению органического вещества в пользу фитопланктона. 1
• Увеличение численности бактерий и вирусов приводит к обогащению эвфотической зоны питательными веществами, в частности азотом, фосфором и железом. 1

Бактерии играют ключевую роль в разложении органического вещества. 5 Они разрушают мёртвые растения и животных, превращая их в простые органические соединения. 5 Этот процесс называется минерализацией и является важным звеном в круговороте веществ в природе. 5

Также микроорганизмы участвуют в биогеохимических циклах, таких как углеродный, азотный, серный и фосфорный циклы. 5 Они катализируют химические реакции, необходимые для преобразования элементов из одной формы в другую, что позволяет поддерживать баланс веществ в экосистемах. 5