Режим реки Лена влияет на навигацию и экономическую деятельность в её бассейне следующим образом:

• Для навигации характер реки неоднородный и сложный на всём протяжении. 3 Колебания глубин существенны, часто случаются разливы, а русло может менять свои границы. 3 Например, участок от истока до Усть-Кута проходим только в период поднятия воды и только для судов с небольшой осадкой, так как здесь небольшие глубины и много мелководных перекатов. 3 Участок от порта Осетрово (Усть-Кут) до устья пригоден для постоянного судоходства, однако здесь немало опасных для прохождения судов зон. 3
• Ледовый режим реки мешает хозяйственному использованию, так как на ней нередки ледовые заторы. 5

Для экономической деятельности Лена важна как главная транспортная магистраль, соединяющая Забайкалье и Якутию с другими регионами. 5 По ней производится основная часть «северного завоза». 2 Также река подходит для рыбалки: в ней активно плодится рыба, в том числе ценные породы. 5