Река Конго влияет на экосистему Атлантического океана, опресняя его на 75 км от берега за счёт огромных масс воды, которые выносятся рекой в океан. 5
Кроме того, бассейн Конго служит связующим звеном между южной частью Атлантического океана и океаном Тетис. 1 В пресноводных и морских местообитаниях, образованных водами реки, откладываются богатые пыльцой, окаменелостями беспозвоночных и позвоночных, в первую очередь рыб. 1
Также на берегах Конго располагаются национальные парки, где обитает множество диких животных, птиц и пресмыкающихся. 2 Многие из рыб бассейна Конго имеют промысловое значение: нильский окунь, тилапия, барбусы, большая тигровая рыба, пресноводная сельдь и другие. 5