Пресноводные экосистемы влияют на окружающую среду и климат следующим образом:

• Интегрируют изменения окружающей среды. 3 Большая часть загрязняющих веществ, выпадающих на территорию водосбора, в конечном итоге оказывается в водоёме, и его состояние может быть показателем нагрузки на весь этот район. 3
• Регулируют температурный и водный баланс. 5 Температура воздуха определяет как температуру воды, так и многие химические свойства, влияющие на качество воды (например, уровень растворённого кислорода). 4
• Чувствительны к потеплению. 4 Повышение температуры и изменение режимов стока приводят к значительным изменениям в биоразнообразии пресноводных ресурсов. 4

Кроме того, пресноводные экосистемы поддерживают жизнь всех живых существ, а человеку обеспечивают ведение хозяйственной деятельности, включая орошение, промышленное производство, рыборазведение, судоходство. 5