В наше время река Онега используется для судоходства на отдельных плёсах. 12 Длина верхнего судоходного участка «Каргополь — озеро Лача» — 6 км, нижнего — от села Порог до устья, — 30 км. 12

Также Онега служит для сплава. 12 В устье реки осуществляется лов сёмги и наваги. 12

Кроме того, по реке Онеге совершает несколько рейсов в неделю небольшой теплоход «Заря» по маршруту село Порог — село Усть-Кожа. 5

На Онеге расположены города Каргополь (в верхнем течении) и Онега (в устье) — крупные центры лесной промышленности. 12