Чабрец ползучий в природе растёт в местах с песчаными, каменистыми почвами: на склонах, сухих лугах, по обочинам дорог, среди кустарников, в светлых лесах лесостепной, степной (реже — лесной) зон европейской части, Западной Сибири. 2
Также встречается в сосновых лесах, в том числе на опушках и полянах, на каменистых склонах, боровых песках, в степях. 1
Естественный ареал чабреца ползучего — Европа, Западная и Восточная Сибирь. 1 Обилен преимущественно в степной зоне. 3 В лесной и полярно-арктической зонах встречается только на повышенных участках. 3