Фауна Большого рифа в Subnautica уникальна тем, что в этом биоме обитают два разных левиафана: Призрачный левиафан и Морской бродяга левиафан. 2

Также среди обитателей Большого рифа есть:

• Морской топтун. 1 Травоядное существо огромных размеров, которое поедает всю растительность. 1 Способен ранить человека в целях самообороны. 1
• Призрачный левиафан. 1 Самое опасное существо в этом биоме. 1

На поверхности Большого рифа вся фауна травоядна и безобидна для игрока, за исключением морского топтуна и призрачных левиафанов. 1