Кордон и кардон — это разные слова, каждое из которых имеет своё значение. 12

Кордон может означать:

• растянутое расположение войск небольшими отрядами вдоль определённой линии (фронт, государственная граница и другое); 13
• оцепление важных государственных объектов, состоящее из отрядов силовиков; 13
• пограничный или заградительный отряд и место его расположения; 13
• пост лесной стражи. 13

Кардон — это растение. 2

Таким образом, основное отличие в том, что кордон — это общее название для различных понятий, а кардон — это конкретное значение слова «растение».